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为了得到活体RNA结构,很多研究人员把目标转向了*(DMS),这种化学物质可以渗透至细胞内部,在那里它可以和4种RNA的核苷酸中的2种——腺嘌呤和胞嘧啶——发生反应,但其前提条件是核苷酸必须处于不结对的状态。研究人员随后把RNA转化为DNA,并对其进行了测序。研究发现,任何在DMS作用下发生改变的核苷酸都会阻止RNA转化为DNA,因此,研究人员可以事先利用DNA缩短的片段分辨没有结对的核苷酸。
很多研究人员希望可以看到更多折叠在一个细胞中的RNA,因为他们认为互作蛋白会让细胞内的RNA结构处于稳定状态。但是,Weissman和团队的发现与此相反。现在他们认为,这种现象可能是因为细胞中的信使RNA在主动生成蛋白质——而更松散的分子对于细胞的蛋白合成机制来说更易于获得。
然而,DMS方法也有缺陷,
http://www.shtpbio。。com/tongpai-SonList-187261/ 乳腺癌细胞 该方法仅能揭示出可以结对的2种核苷酸。为了获得细胞内每个RNA分子的结对信息,Chang和Spitale采用了一种叫作SHAPE的结构探测技术。该技术可以让他们推断小鼠胚胎干细胞中的19000多种RNA分子结构,相关研究成果于今年年初发表。研究人员表示,对信使RNA进行常见的化学改性,就可以解开这种分子的结构特征。他们还探测到一些*的结构“签名"——这些特征可预测蛋白质在哪里与RNA结合,从而控制RNA的形状。
一些研究人员已经开始采用这种技术。Assmann和Bevilacqua正在利用大米探测RNA的结构,并计划用其他重要农作物开展同样的实验。他们希望可以找到操控RNA形状的方法,从而提高作物耐受性和产量。
与此同时,Rouskin正试图研究果蝇的RNA,以便进一步了解这些分子结构如何影响胚胎发育。“现在,我们终于有了一种研究工具。"她说,“我们也终于可以就以前那些甚至不敢想象的问题发问了。"
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