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(BeWo细胞株*)乳癌和其他癌症的基因组测序研究
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乳癌中的APOBEC3B表达与细胞增殖密切相关。发现一种缺失多样性与免疫激活有关。研究揭示了“T细胞受体”是识别人体内正常细胞和病毒的关键。
乳癌和其他癌症的基因组测序研究,已经确定了APOBEC3B (A3B,AID/APOBEC胞苷脱氨酶家族成员)内源性增变基因活性所引起的突变模式。
A3B是一种细胞脱氨酶,在许多肿瘤中是超表达的,被认为是癌症相关突变的一个重要原因,但是,引起A3B上调的因素仍不明确。此外,还存在一种共同的细胞缺失多样性(A3Bdel),因此,很大一部分的人群并不表达A3B蛋白。
为了检测A3B在乳癌中的表达及其结构性缺失的原因和后果,分析了两大临床注释的乳癌数据集——The Cancer Genome Atlas (TCGA) and the molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium (METABRIC),试图解决这些观察结果所提出的生物学和临床问题,主要目的是解决基因表达和多态性关联之间的不一致性。
研究确认,A3B表达与侵袭性临床病理特征及预后不良有关,并表明在乳癌和16种其他实体瘤的15种肿瘤中,A3B表达与增殖特征高度相关(有丝分裂和细胞周期相关基因的表达)。
A3B缺失的纯合子a3bdel所引起的乳癌患者的这些特征并没有不同,从而表明A3B表达是增殖增加的一种反映而不是直接原因。利用基因集合富集分析(GSEA),在a3bdel乳癌中检测到了一种免疫激活模式,似乎与a3bdel携带者中出现的突变相关。
这些结果为A3B超表达及其预后影响提供了一个解释,支持将这个增变基因作为一个癌症生物标志物或药物靶点。尽管a3bdel的免疫特征还需要更多的研究,但这些研究结果仍然推荐将a3bdel多态性作为肿瘤免疫治疗的一个潜在预测因子。
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